功能性食品目前没有一个准确定义，大部分情况下指的是具有特定营养保健功能的食品，即适宜特定人群食用，具有调节机体功能，不以治疗为目的的食品。功能性食品代加工则需要根据国内对不同类别产品的具体标准进行针对性操作，必须保证产品及项目合规性，这是基本前提。
根据《食品安全法》的规定，我国食品类别可划分为普通食品与特殊食品两大类，特殊食品中包含了保健食品，分类中并没有“功能性食品”的名称。功能性食品在国内不是一个法定的概念，在特定概念上，它是具有特定营养保健功能的食品。这类食品在国外其实叫作膳食补充剂或者机能性食品。因此，按照常规理解，对应食品代工企业的生产许可明细，可对应一下两个类别：
1，特殊膳食食品：为满足特殊的身体或生理状况和(或)满足疾病、紊乱等状态下的特殊膳食需求，专门加工或配方 的食品。这类食品的营养素和(或)其他营养成分的含量与可类比的普通食品有显著不同。
2，保健食品：指声称并具有特定保健功能或者以补充维生素、矿物质为目的的食品。即适用于特定人群食用,具有调节机体功能，不以治疗疾病为目的，并且对人体不产生任何急性、亚急性或慢性危害的食品。
1，特殊膳食食品代加工：客户(委托方)办理营业执照和经营许可证，便可找工厂代工合作。不同品类产品的标志性成分含量需要达到对应执行标准的要求。
2，保健食品代加工：委托方需要携带自有健字号，寻找拥有GMP车间标准的代工厂合作，通过工厂备案并且取得生产批件以后，便可开展保健食品代工活动。健字号保健食品代加工是批号对应的特定产品的委托生产，产品固定，并且OEM工厂必须具备对应产品的完整生产工艺，否则工厂无法接单。
在大健康食品代加工行业，也有一部分投资者会将压片糖果、固体饮料、代用茶等药食同源产品归类为功能性食品。这种分类方式并不符合产品类别的定义。压片糖果、固体饮料、代用茶属于普通食品，不限定特定人群，不具备保健功能。但是由于此类产品的起步门槛，更适合药食同源产品代加工项目，因此也备受青睐。
功能性食品代加工为特殊膳食和保健食品代工项目，涵盖片剂、粉剂、颗粒、胶囊等多个剂型，对工厂车间、工艺、设备、流程以及相关的仓储和品控都有严格要求。找工厂OEM贴牌合作，需要严格执行相关标准。
